Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB43Q86YS6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms