Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDSS2Q86YH6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDSS2Q86YH6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDSS2Q86YH6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDSS2Q86YH6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDSS2Q86YH6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDSS2Q86YH6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDSS2Q86YH6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDSS2Q86YH6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDSS2Q86YH6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDSS2Q86YH6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDSS2Q86YH6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDSS2Q86YH6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDSS2Q86YH6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDSS2Q86YH6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDSS2Q86YH6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDSS2Q86YH6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms