Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00523Q86TU6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC00523Q86TU6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00523Q86TU6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms