Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms