Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLNKQ7Z7G1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLNKQ7Z7G1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms