Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHST3Q7LGC8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHST3Q7LGC8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHST3Q7LGC8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms