Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SV2BQ7L1I2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SV2BQ7L1I2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms