Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS27LQ71UM5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms