Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC55Q6ZSA7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC55Q6ZSA7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms