Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC73Q6ZRK6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC73Q6ZRK6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms