Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRAIDQ6UW56 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRAIDQ6UW56 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms