Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC0.15□□□□□ -2.386e-46■■■■■ 58.8
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PRPF8Q6P2Q9 COPS5-205ENST00000518374 1451 ntTSL 28.12□□□□□ -1.113e-15■■■■■ 58.8
PRPF8Q6P2Q9 COPS5-201ENST00000357849 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.173e-15■■■■■ 58.8
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PRPF8Q6P2Q9 COPS5-213ENST00000523890 1086 ntTSL 37.11□□□□□ -1.273e-15■■■■■ 58.8
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PRPF8Q6P2Q9 DDIAS-211ENST00000533655 3533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.281e-15■■■■■ 58.2
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PRPF8Q6P2Q9 DDIAS-206ENST00000528262 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 45.52□□□□□ -1.531e-15■■■■■ 58.2
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PRPF8Q6P2Q9 NT5DC1-202ENST00000417846 417 ntTSL 34.57□□□□□ -1.681e-15■■■■■ 58.2
PRPF8Q6P2Q9 C20orf196-204ENST00000445603 501 ntTSL 34.48□□□□□ -1.691e-15■■■■■ 58.2
PRPF8Q6P2Q9 TMX3-209ENST00000566887 697 ntTSL 33.53□□□□□ -1.843e-15■■■■■ 58.2
PRPF8Q6P2Q9 C20orf196-203ENST00000442185 627 ntTSL 33.32□□□□□ -1.881e-15■■■■■ 58.2
PRPF8Q6P2Q9 ATP2B1-206ENST00000549727 1430 ntTSL 23.18□□□□□ -1.91e-15■■■■■ 58.2
PRPF8Q6P2Q9 ATP2B1-208ENST00000551009 943 ntTSL 32.08□□□□□ -2.081e-15■■■■■ 58.2
PRPF8Q6P2Q9 PALB2-203ENST00000565038 344 ntTSL 31.1□□□□□ -2.231e-15■■■■■ 58.2
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PRPF8Q6P2Q9 BAZ1A-210ENST00000555331 579 ntTSL 30.63□□□□□ -2.311e-15■■■■■ 58.2
PRPF8Q6P2Q9 RFWD2-205ENST00000459744 741 ntTSL 30.12□□□□□ -2.391e-15■■■■■ 58.2
PRPF8Q6P2Q9 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.874e-15■■■■■ 58.1
PRPF8Q6P2Q9 TMEM138-208ENST00000540194 587 ntTSL 312.26□□□□□ -0.458e-8■■■■■ 58.1
PRPF8Q6P2Q9 TMEM138-206ENST00000534963 740 ntTSL 1 (best)4.47□□□□□ -1.698e-8■■■■■ 58.1
PRPF8Q6P2Q9 USP7-213ENST00000566131 569 ntTSL 20.42□□□□□ -2.341e-8■■■■■ 58.1
PRPF8Q6P2Q9 NACA-215ENST00000550920 752 ntTSL 59.06□□□□□ -0.966e-10■■■■■ 58.1
PRPF8Q6P2Q9 NACA-210ENST00000548386 644 ntTSL 20.68□□□□□ -2.36e-10■■■■■ 58.1
PRPF8Q6P2Q9 MFSD9-205ENST00000437075 2440 ntTSL 515.79■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 58
PRPF8Q6P2Q9 MFSD9-206ENST00000438943 2990 ntTSL 513.16□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 58
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