Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC70Q6NSX1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC70Q6NSX1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC70Q6NSX1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms