Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUMO4Q6EEV6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms