Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ANKRD40Q6AI12 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ANKRD40Q6AI12 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms