Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPECC1LQ69YQ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms