Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.15
CHIC1Q5VXU3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
CHIC1Q5VXU3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
CHIC1Q5VXU3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CHIC1Q5VXU3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms