Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC1Q5TB30 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC1Q5TB30 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms