Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC18Q5T9S5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.62
CCDC18Q5T9S5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC18Q5T9S5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms