Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMTC4Q5T4D3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMTC4Q5T4D3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms