Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
FRMPD1Q5SYB0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FRMPD1Q5SYB0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
FRMPD1Q5SYB0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms