Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV6

EXOSC6, Exosome complex component MTR3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC6Q5RKV6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC6Q5RKV6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXOSC6Q5RKV6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms