Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MIA3Q5JRA6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIA3Q5JRA6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms