Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1JQ5JR12 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1JQ5JR12 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1JQ5JR12 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms