Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms