Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL39P5Q59GN2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms