Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CDCA8Q53HL2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CDCA8Q53HL2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CDCA8Q53HL2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA8Q53HL2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms