Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC92Q53HC0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms