Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR1Q2NL82 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR1Q2NL82 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSR1Q2NL82 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR1Q2NL82 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR1Q2NL82 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR1Q2NL82 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR1Q2NL82 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR1Q2NL82 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR1Q2NL82 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSR1Q2NL82 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR1Q2NL82 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR1Q2NL82 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TSR1Q2NL82 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TSR1Q2NL82 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSR1Q2NL82 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms