Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDK4Q16654 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDK4Q16654 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms