Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPS6KA1Q15418 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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