Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR1Q15399 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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