Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.265e-7■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 IFITM2-203ENST00000527146 634 ntTSL 314.28□□□□□ -0.123e-43■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.143e-43■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 IFITM2-202ENST00000399817 659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.233e-43■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 IFITM2-206ENST00000616316 892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.773e-43■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 38.1
PCBP1Q15365 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 38.1
PCBP1Q15365 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 38.1
PCBP1Q15365 FBXW7-212ENST00000604872 970 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 38.1
PCBP1Q15365 FBXW7-205ENST00000603548 2562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 38.1
PCBP1Q15365 SPIN4-201ENST00000374884 4117 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 38.1
PCBP1Q15365 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 38
PCBP1Q15365 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.94e-7■■■■■ 37.9
PCBP1Q15365 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.814e-7■■■■■ 37.9
PCBP1Q15365 UBE2E3-207ENST00000602499 744 ntTSL 224.32■■□□□ 1.484e-7■■■■■ 37.9
PCBP1Q15365 UBE2E3-206ENST00000602479 752 ntTSL 324.18■■□□□ 1.464e-7■■■■■ 37.9
PCBP1Q15365 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.264e-7■■■■■ 37.9
PCBP1Q15365 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.924e-7■■■■■ 37.9
PCBP1Q15365 UBE2E3-203ENST00000602291 766 ntTSL 310.6□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 37.9
PCBP1Q15365 UBE2E3-210ENST00000602762 340 ntTSL 38.69□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 37.9
PCBP1Q15365 UBE2E3-204ENST00000602303 654 ntTSL 57.67□□□□□ -1.184e-7■■■■■ 37.9
PCBP1Q15365 UBE2E3-212ENST00000602888 499 ntTSL 26.85□□□□□ -1.314e-7■■■■■ 37.9
PCBP1Q15365 ATN1-203ENST00000537488 899 ntTSL 218.12■□□□□ 0.497e-15■■■■■ 37.9
PCBP1Q15365 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-9■■■■■ 37.8
PCBP1Q15365 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.151e-9■■■■■ 37.8
PCBP1Q15365 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.82e-12■■■■■ 37.8
PCBP1Q15365 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-12■■■■■ 37.8
PCBP1Q15365 LAMA5-214ENST00000497363 579 ntTSL 318.36■□□□□ 0.533e-29■■■■■ 37.6
PCBP1Q15365 YIPF3-214ENST00000510102 1639 ntTSL 517.93■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 37.6
PCBP1Q15365 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 37.6
PCBP1Q15365 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.16e-7■■■■■ 37.6
PCBP1Q15365 TMEM214-202ENST00000321326 2700 ntTSL 219.45■□□□□ 0.78e-7■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.698e-7■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.358e-7■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 WNK4-204ENST00000591448 3909 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 WNK4-201ENST00000246914 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.553e-8■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 WNK4-203ENST00000587745 188 ntTSL 54.08□□□□□ -1.763e-8■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 LTBP4-202ENST00000243562 3140 ntTSL 214.27□□□□□ -0.135e-8■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 ARHGEF10L-201ENST00000167825 3018 ntTSL 214.01□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 ARHGEF10L-206ENST00000469726 4585 ntTSL 213.52□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 ARHGEF10L-204ENST00000375415 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 CAPZB-207ENST00000459967 579 ntTSL 317.98■□□□□ 0.479e-7■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 CAPZB-208ENST00000482808 660 ntTSL 217.29■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.069e-7■■■■■ 37.5
PCBP1Q15365 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 37.4
PCBP1Q15365 VPS25-203ENST00000589520 639 ntTSL 311.18□□□□□ -0.625e-8■■■■■ 37.3
PCBP1Q15365 TMEM219-209ENST00000602948 588 ntTSL 220.07■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 37.3
PCBP1Q15365 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 37.3
PCBP1Q15365 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 37.3
PCBP1Q15365 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 37.3
PCBP1Q15365 TMEM219-208ENST00000575829 721 ntTSL 515.13■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 37.3
PCBP1Q15365 GAK-209ENST00000507580 468 ntTSL 423.44■■□□□ 1.342e-9■■■■■ 37.2
PCBP1Q15365 GAK-207ENST00000505819 1326 ntTSL 523.06■■□□□ 1.282e-9■■■■■ 37.2
PCBP1Q15365 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.472e-9■■■■■ 37.2
PCBP1Q15365 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 37.2
PCBP1Q15365 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 37.2
PCBP1Q15365 TMEM59L-204ENST00000598660 1683 ntTSL 523.96■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 37.1
PCBP1Q15365 SEPT9-227ENST00000590059 670 ntTSL 523.09■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 37.1
PCBP1Q15365 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 422.69■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 37.1
PCBP1Q15365 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 37.1
PCBP1Q15365 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 37.1
PCBP1Q15365 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 01e-6■■■■■ 37.1
PCBP1Q15365 SMARCD1-207ENST00000549526 401 ntTSL 59.13□□□□□ -0.957e-11■■■■■ 37.1
PCBP1Q15365 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 37.1
PCBP1Q15365 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.281e-8■■■■■ 37
PCBP1Q15365 SEZ6L2-201ENST00000308713 3801 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 37
PCBP1Q15365 MOSPD3-205ENST00000462372 979 ntTSL 525.87■■□□□ 1.735e-8■■■■■ 36.9
PCBP1Q15365 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.695e-8■■■■■ 36.9
PCBP1Q15365 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.485e-8■■■■■ 36.9
PCBP1Q15365 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.425e-8■■■■■ 36.9
PCBP1Q15365 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.575e-8■■■■■ 36.9
PCBP1Q15365 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.269e-10■■■■■ 36.9
PCBP1Q15365 MBD6-206ENST00000548550 563 ntTSL 417.07■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 36.9
PCBP1Q15365 REEP6-202ENST00000395479 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.88■□□□□ 0.773e-10■■■■■ 36.8
PCBP1Q15365 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.194e-11■■■■■ 36.8
PCBP1Q15365 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.044e-11■■■■■ 36.8
PCBP1Q15365 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 36.7
PCBP1Q15365 LZTS2-205ENST00000454422 804 ntTSL 234.59■■■■□ 3.132e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.562e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.72e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KPNA1-210ENST00000494339 1923 ntTSL 222.35■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 POLD1-204ENST00000593981 873 ntTSL 521.86■■□□□ 1.094e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GCDH-214ENST00000591043 1764 ntTSL 521.67■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 GCDH-202ENST00000421816 1109 ntTSL 221.4■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 421.1■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 POLD1-202ENST00000593407 867 ntTSL 520.92■□□□□ 0.944e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 POLD1-208ENST00000596648 1048 ntTSL 520.89■□□□□ 0.934e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 UQCRQ-204ENST00000480372 509 ntTSL 220.5■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 36.4
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