Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRLQ15198 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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