Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD1Q15011 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERPUD1Q15011 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERPUD1Q15011 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms