Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHD4Q14839 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHD4Q14839 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
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