Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE7AQ13946 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE7AQ13946 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE7AQ13946 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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