Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL4BQ13620 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CUL4BQ13620 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
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