Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPP1R1AQ13522 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPP1R1AQ13522 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R1AQ13522 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R1AQ13522 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R1AQ13522 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R1AQ13522 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R1AQ13522 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R1AQ13522 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPP1R1AQ13522 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R1AQ13522 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPP1R1AQ13522 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms