Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3AQ13472 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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