Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKZF1Q13422 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IKZF1Q13422 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IKZF1Q13422 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms