Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
MSLNQ13421 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSLNQ13421 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
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