Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF6Q13247 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF6Q13247 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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