Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
GRIN2BQ13224 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
GRIN2BQ13224 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC40.24■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
GRIN2BQ13224 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
GRIN2BQ13224 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
GRIN2BQ13224 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC40.07■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
GRIN2BQ13224 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
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