Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 ECM14YHR132C 1293 nt5.88□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 FAF1YIL019W 1041 nt5.88□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 EFM3YJR129C 1020 nt5.88□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 YOL163WYOL163W 510 nt5.88□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 CRF1YDR223W 1404 nt5.88□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 WHI2YOR043W 1461 nt5.88□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 VPS24YKL041W 675 nt5.87□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 SCS7YMR272C 1155 nt5.87□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 SCS22YBL091C-A 528 nt5.87□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 OSW2YLR054C 2175 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 MNN5YJL186W 1761 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 YEL020CYEL020C 1683 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 YFR006WYFR006W 1608 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 CNE1YAL058W 1509 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 CDC1YDR182W 1476 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 TEP1YNL128W 1305 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 RPT3YDR394W 1287 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 BCY1YIL033C 1251 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 YMR122CYMR122C 375 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 MRC1YCL061C 3291 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 COG1YGL223C 1254 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 TFG2YGR005C 1203 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 YIL077CYIL077C 963 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 YHC3YJL059W 1227 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 RRS1YOR294W 612 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 IFA38YBR159W 1044 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 MTC5YDR128W 3447 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 POX1YGL205W 2247 nt5.84□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 VPS5YOR069W 2028 nt5.84□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 KKQ8YKL168C 2175 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 HST3YOR025W 1344 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 LDS1YAL018C 978 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 TSA1YML028W 591 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 GLN1YPR035W 1113 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 ATF1YOR377W 1578 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 YET3YDL072C 612 nt5.82□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 CDC34YDR054C 888 nt5.82□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 YEL068CYEL068C 333 nt5.82□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 FZF1YGL254W 900 nt5.82□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 MSP1YGR028W 1089 nt5.82□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.82□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.82□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.82□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.82□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.82□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 IVY1YDR229W 1362 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 VPS4YPR173C 1314 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 FRS2YFL022C 1512 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 MAK31YCR020C-A 267 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 TDH2YJR009C 999 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 PSR2YLR019W 1194 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 YHM2YMR241W 945 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 TSR3YOR006C 942 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 CLB2YPR119W 1476 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 PCS60YBR222C 1632 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 CIT3YPR001W 1461 nt5.8□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 RMA1YKL132C 1293 nt5.8□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 MRPS12YNR036C 462 nt5.8□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 MRPS16YPL013C 366 nt5.8□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 MDM31YHR194W 1740 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 PMP3YDR276C 168 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 OPI7YDR360W 435 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 RPN11YFR004W 921 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 DRE2YKR071C 1047 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 YPR114WYPR114W 948 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 SAC6YDR129C 1929 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 YFL042CYFL042C 2025 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 GFA1YKL104C 2154 nt5.79□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 ERG1YGR175C 1491 nt5.78□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 BZZ1YHR114W 1902 nt5.78□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 NHA1YLR138W 2958 nt5.78□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 SKN1YGR143W 2316 nt5.78□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 RPE1YJL121C 717 nt5.78□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 YNR040WYNR040W 771 nt5.78□□□□□ -1.48
RPN6Q12377 TRP5YGL026C 2124 nt5.77□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 MAK32YCR019W 1092 nt5.77□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.77□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 MDH1YKL085W 1005 nt5.77□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 YDR015CYDR015C 240 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 HVG1YER039C 750 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 SHO1YER118C 1104 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 CAF40YNL288W 1122 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 VMA4YOR332W 702 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 EMW1YNL313C 2715 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 YPL277CYPL277C 1464 nt5.76□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 ICL1YER065C 1674 nt5.75□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 PTK2YJR059W 2457 nt5.75□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 EHD3YDR036C 1503 nt5.75□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 RPL7AYGL076C 735 nt5.75□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 RPL7BYPL198W 735 nt5.75□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 AMA1YGR225W 1782 nt5.75□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 SUB2YDL084W 1341 nt5.74□□□□□ -1.49
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