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Protein–RNA interactions for Protein: Q12090
REX3, RNA exonuclease 3, yeast
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404 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
REX3
Q12090
HBN1
YCL026C-B
582 nt
5.94
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
RAP1
YNL216W
2484 nt
5.94
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
IRC11
YOR013W
471 nt
5.93
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
YPL257W
YPL257W
582 nt
5.93
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
RIO1
YOR119C
1455 nt
5.93
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
GPD2
YOL059W
1323 nt
5.93
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
CYB2
YML054C
1776 nt
5.93
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
YMR279C
YMR279C
1623 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
EDE1
YBL047C
4146 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
tG(GCC)B
tG(GCC)B
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
SUF16
tG(GCC)C
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
tG(GCC)D1
tG(GCC)D1
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
tG(GCC)D2
tG(GCC)D2
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
tG(GCC)E
tG(GCC)E
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
SUF20
tG(GCC)F1
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
tG(GCC)F2
tG(GCC)F2
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
tG(GCC)G1
tG(GCC)G1
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
tG(GCC)G2
tG(GCC)G2
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
tG(GCC)J1
tG(GCC)J1
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
SUF23
tG(GCC)J2
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
tG(GCC)M
tG(GCC)M
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
tG(GCC)O1
tG(GCC)O1
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
SUF17
tG(GCC)O2
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
tG(GCC)P1
tG(GCC)P1
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
tG(GCC)P2
tG(GCC)P2
71 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
VAM7
YGL212W
951 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
OGG1
YML060W
1131 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
YMR135W-A
YMR135W-A
534 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
YPL250W-A
YPL250W-A
288 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
YPR204W
YPR204W
3099 nt
5.92
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
YEL075W-A
YEL075W-A
612 nt
5.91
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
NTG1
YAL015C
1200 nt
5.91
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
YLR463C
YLR463C
552 nt
5.91
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
PET112
YBL080C
1626 nt
5.91
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
PYC1
YGL062W
3537 nt
5.91
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
TAH11
YJR046W
1815 nt
5.9
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
FHL1
YPR104C
2811 nt
5.9
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
PPH22
YDL188C
1134 nt
5.9
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
MIA40
YKL195W
1212 nt
5.9
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
GEP5
YLR091W
882 nt
5.9
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
RDL1
YOR285W
420 nt
5.9
□□□□□ -1.46
REX3
Q12090
YDR387C
YDR387C
1668 nt
5.9
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
NPL6
YMR091C
1308 nt
5.9
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
GUS1
YGL245W
2127 nt
5.9
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
CSC1
YLR241W
2349 nt
5.9
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
YJL211C
YJL211C
444 nt
5.89
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
AAT2
YLR027C
1257 nt
5.89
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
YMR295C
YMR295C
594 nt
5.89
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
SPC97
YHR172W
2472 nt
5.89
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
RGD2
YFL047W
2145 nt
5.89
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
YLR157W-E
YLR157W-E
165 nt
5.88
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
MRPL10
YNL284C
969 nt
5.88
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
SLD7
YOR060C
774 nt
5.88
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
STT3
YGL022W
2157 nt
5.88
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
NUP1
YOR098C
3231 nt
5.87
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
YDR415C
YDR415C
1125 nt
5.87
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
COX16
YJL003W
357 nt
5.87
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
MSO1
YNR049C
633 nt
5.87
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
PEX3
YDR329C
1326 nt
5.87
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
ATG23
YLR431C
1362 nt
5.87
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
CTS2
YDR371W
1536 nt
5.86
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
QRI1
YDL103C
1434 nt
5.86
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
PTC3
YBL056W
1407 nt
5.86
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
MSP1
YGR028W
1089 nt
5.86
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
MPC2
YHR162W
390 nt
5.86
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
CTF8
YHR191C
402 nt
5.86
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
YJR084W
YJR084W
1272 nt
5.86
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
ATG17
YLR423C
1254 nt
5.86
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
YML133C
YML133C
4125 nt
5.86
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
ALT1
YLR089C
1779 nt
5.85
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
PPT1
YGR123C
1542 nt
5.85
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
YPT1
YFL038C
621 nt
5.85
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
YKR032W
YKR032W
315 nt
5.85
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
AVO2
YMR068W
1281 nt
5.85
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
LDB16
YCL005W
771 nt
5.85
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
BZZ1
YHR114W
1902 nt
5.85
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
CNM67
YNL225C
1746 nt
5.85
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
RNR3
YIL066C
2610 nt
5.84
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
ISC1
YER019W
1434 nt
5.84
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
FLC3
YGL139W
2409 nt
5.84
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
COX20
YDR231C
618 nt
5.84
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
YGR176W
YGR176W
348 nt
5.84
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
REV7
YIL139C
738 nt
5.84
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
MDE1
YJR024C
735 nt
5.84
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
YML018C
YML018C
1182 nt
5.84
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
REC114
YMR133W
1287 nt
5.84
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
TUL1
YKL034W
2277 nt
5.84
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
GPH1
YPR160W
2709 nt
5.84
□□□□□ -1.47
REX3
Q12090
ERG1
YGR175C
1491 nt
5.83
□□□□□ -1.48
REX3
Q12090
YDL085C-A
YDL085C-A
207 nt
5.83
□□□□□ -1.48
REX3
Q12090
SNF11
YDR073W
510 nt
5.83
□□□□□ -1.48
REX3
Q12090
HSP150
YJL159W
1242 nt
5.83
□□□□□ -1.48
REX3
Q12090
VAN1
YML115C
1608 nt
5.83
□□□□□ -1.48
REX3
Q12090
ARE2
YNR019W
1929 nt
5.83
□□□□□ -1.48
REX3
Q12090
YLL066C
YLL066C
3618 nt
5.82
□□□□□ -1.48
REX3
Q12090
RGD1
YBR260C
2001 nt
5.82
□□□□□ -1.48
REX3
Q12090
YLH47
YPR125W
1365 nt
5.82
□□□□□ -1.48
REX3
Q12090
RMD9
YGL107C
1941 nt
5.82
□□□□□ -1.48
REX3
Q12090
HVG1
YER039C
750 nt
5.82
□□□□□ -1.48
REX3
Q12090
YNL120C
YNL120C
486 nt
5.82
□□□□□ -1.48
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