Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	HOC1	YJR075W	1191 nt		5.95	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	YLR296W	YLR296W	327 nt		5.95	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	MSO1	YNR049C	633 nt		5.95	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	CPA1	YOR303W	1236 nt		5.95	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	LGE1	YPL055C	999 nt		5.95	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	YMC1	YPR058W	924 nt		5.95	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	PAP2	YOL115W	1755 nt		5.95	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	MCH1	YDL054C	1461 nt		5.95	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	EPS1	YIL005W	2106 nt		5.95	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	CHO1	YER026C	831 nt		5.94	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	SOH1	YGL127C	384 nt		5.94	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	YHR070C-A	YHR070C-A	411 nt		5.94	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	SRL2	YLR082C	1179 nt		5.94	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	TRP3	YKL211C	1455 nt		5.94	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	EXG1	YLR300W	1347 nt		5.94	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	CHL4	YDR254W	1377 nt		5.93	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	GPT2	YKR067W	2232 nt		5.93	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	TIM22	YDL217C	624 nt		5.93	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	CWC21	YDR482C	408 nt		5.93	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	TMT1	YER175C	900 nt		5.93	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	LIA1	YJR070C	978 nt		5.93	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	GTO3	YMR251W	1101 nt		5.93	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	PRE5	YMR314W	705 nt		5.93	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	YNL017C	YNL017C	339 nt		5.93	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	YOL131W	YOL131W	327 nt		5.93	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	LSC1	YOR142W	990 nt		5.93	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	MRP51	YPL118W	1035 nt		5.93	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	FAT3	YKL187C	2253 nt		5.93	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	GSY2	YLR258W	2118 nt		5.93	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	RIM101	YHL027W	1878 nt		5.92	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	RPL10	YLR075W	666 nt		5.92	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	PTC4	YBR125C	1182 nt		5.92	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	SCT1	YBL011W	2280 nt		5.92	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	SET5	YHR207C	1581 nt		5.92	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	SPS22	YCL048W	1392 nt		5.92	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	XBP1	YIL101C	1944 nt		5.91	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	TBF1	YPL128C	1689 nt		5.91	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	GEX1	YCL073C	1848 nt		5.91	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	MCP1	YOR228C	909 nt		5.91	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	CMR1	YDL156W	1569 nt		5.91	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	CHS5	YLR330W	2016 nt		5.91	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	SSK22	YCR073C	3996 nt		5.9	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	GDA1	YEL042W	1557 nt		5.9	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	GEP5	YLR091W	882 nt		5.9	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	LDB7	YBL006C	543 nt		5.9	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	DAP1	YPL170W	459 nt		5.9	□□□□□ -1.46
VIK1	Q12045	PYC2	YBR218C	3543 nt		5.9	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	AMD2	YDR242W	1650 nt		5.89	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	DBP9	YLR276C	1785 nt		5.89	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	RRP46	YGR095C	672 nt		5.89	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	TAF9	YMR236W	474 nt		5.89	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	POR1	YNL055C	852 nt		5.89	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	SPE3	YPR069C	882 nt		5.89	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	GUP2	YPL189W	1830 nt		5.89	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	GAT1	YFL021W	1533 nt		5.89	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	CRZ1	YNL027W	2037 nt		5.88	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	RPT3	YDR394W	1287 nt		5.88	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	AAD14	YNL331C	1131 nt		5.88	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	GUA1	YMR217W	1578 nt		5.88	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	STE13	YOR219C	2796 nt		5.88	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	CDC16	YKL022C	2523 nt		5.87	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	LCL3	YGL085W	825 nt		5.87	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	PTC3	YBL056W	1407 nt		5.87	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	BIO3	YNR058W	1443 nt		5.87	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	ILV1	YER086W	1731 nt		5.86	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	YTP1	YNL237W	1380 nt		5.86	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	GPD1	YDL022W	1176 nt		5.86	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	SPG1	YGR236C	288 nt		5.86	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	OM45	YIL136W	1182 nt		5.86	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	FPR3	YML074C	1236 nt		5.86	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	RPS3	YNL178W	723 nt		5.86	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	YOR268C	YOR268C	399 nt		5.86	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	YCK1	YHR135C	1617 nt		5.85	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	BUG1	YDL099W	1026 nt		5.85	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	NPA3	YJR072C	1158 nt		5.85	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	MHT1	YLL062C	975 nt		5.85	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	MRPS18	YNL306W	654 nt		5.85	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	PFA3	YNL326C	1011 nt		5.85	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	TFB4	YPR056W	1017 nt		5.85	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	HIR1	YBL008W	2523 nt		5.85	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	ROG3	YFR022W	2202 nt		5.84	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	GPD2	YOL059W	1323 nt		5.84	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	YJL171C	YJL171C	1191 nt		5.84	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	YLL067C	YLL067C	3618 nt		5.84	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	AAP1	YHR047C	2571 nt		5.84	□□□□□ -1.47
VIK1	Q12045	SRP101	YDR292C	1866 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	RSC2	YLR357W	2670 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	MPH3	YJR160C	1809 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	COX20	YDR231C	618 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	YGL072C	YGL072C	360 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	SUP2	tY(GUA)D	75 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	SUP11	tY(GUA)F1	75 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	SUP6	tY(GUA)F2	75 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	SUP7	tY(GUA)J1	75 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	SUP4	tY(GUA)J2	75 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	SUP5	tY(GUA)M1	75 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	SUP8	tY(GUA)M2	75 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	SUP3	tY(GUA)O	75 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	YJR084W	YJR084W	1272 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	YMR119W-A	YMR119W-A	375 nt		5.83	□□□□□ -1.48

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