Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC3A1Q07837 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms