Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN1Q05586 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN1Q05586 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN1Q05586 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms