Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL10A1Q03692 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COL10A1Q03692 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL10A1Q03692 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL10A1Q03692 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL10A1Q03692 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms